थीसेन-बोरनेमिसा अजायबघर (स्पैनिश: Museo Thyssen-Bornemisza) मद्रिद स्पेन में स्थित एक गिरजाघर है. ये प्रादो अजायबघर के पास में स्थित है। इसे कला के सनेहरी तिकड़ी के हिस्से की वजह से जाना जाता है, जिसमें परदों और रेएना राष्ट्रीय अजायबघर भी शामिल हैं। 16,000 से भी ज्यादा चित्रों के साथ ये एक समय पर दुनिया का दूसरा सबसे बड़ा अजायबघर था, ब्रिटिश रॉयल के बाद।
इसमें चित्रों के कुलेशन 1920 के पास शुरू हुए। ये बारोन थीसेन-बोरनेमिसा दे कसून की निजी कुलेक्शन थी।